Bioinformatika

Dewasa ini perkembangan ilmu Biologi semakin pesat semenjak ditemukannya metode sekuensing DNA. Dengan data DNA yang begitu melimpah dari berbagai macam spesies, maka diperlukan pengolahan data-data tersebut untuk berbagai keperluan. Data DNA tersebut diintegrasikan dalam suatu penyimpanan data dalam komputer yang kemudian muncul istilah bionfomatika. Bioinformatika sendiri merupakan cabang ilmu biologi yang memadukan pengetahuan biologi, bioteknologi, maupun biologi molekular dengan teknologi informasi yang berupa komputer dan internet. Salah satu tujuannya adalah untuk memahami organisme hidup melalui perkembangan bioinformasi.  

Dalam mempelajari bioinformatika terdapat tiga elemen, yakni database, analisa, dan prediksi. Elemen database ini meliputi database DNA, protein, dan transkripsi RNA. Kemudian elemen analisa meliputi kesamaan sekuens/urutan DNA (homology sequence) dan pencarian pola (pattern) pada urutan DNA. Sementara elemen prediksi meliputi prediksi fungsi gen/protein dan prediksi struktur 3D protein. 
Aplikasi bioinformatika tak lepas dari adanya peningkatan informasi biologi khususnya data sekuens DNA dan protein serta struktur protein. Peningkatan data-data tersebut menjadikan adanya komitmen secara internasional untuk melakukan kolaborasi berupa media penyimpanan data. Beberapa database disimpan oleh: 
  1. GenBank (NCBI) dari USA 
  2. EMBL (EBI) dari Eropa
  3. DDBJ dari Jepang 
Informasi yang tersimpan tersebut dapat diakses kapanpun dan dimanapun selagi terhubung oleh jaringan internet. Berbagai macam data sekuens baik DNA maupun protein dapat digunakan untuk berbagai macam keperluan seperti menentukan primer, analisis gen dan protein, kemiripan DNA interspesies maupun intraspesies, hubungan filogenetik, laju evolusi molekular, dan lain-lainnya. 
Sumber : Generasi Biologi

Komentar

Posting Komentar

Postingan populer dari blog ini

Katalog Keragaman Genetik Kera Besar Memetakan Evolusi Primata dan Konservasi Masa Depan

Gambar
Melalui studi variasi genetik manusia, simpanse, gorila dan orangutan, para peneliti berhasil membangun sebuah model yang menggambarkan sejarah kera besar sepanjang 15 juta tahun terakhir. Katalog keragaman genetik kera besar yang paling komprehensif yang pernah ada ini memaparkan sejarah evolusi dan populasi kera besar asal Afrika dan Indonesia. Sumber daya ini sekaligus dapat membantu upaya konservasi di masa kini dan masa depan untuk melestarikan keragaman genetik dalam berbagai populasi di alam. Sekitar 75 orang ilmuwan dan konservasionis satwa liar dari seluruh dunia turut andil dalam menghasilkan analisis genetik dari 79 ekor kera besar di alam liar maupun yang sudah di penangkaran sejak lahir. Kera-kera ini mewakili keseluruhan enam spesies kera besar: simpanse, bonobo, orangutan sumatera, orangutan Borneo, gorila timur dan gorila dataran rendah barat, serta tujuh subspesies lainnya. Sembilan genom manusia disertakan pula sebagai sampel. “Penelitian ini menyed
Baca selengkapnya

RIBUAN Daftar Nama Latin (Ilmiah) Hewan TERLENGKAP

Gambar
Berikut adalah kumpulan nama latin hewan mulai dari A-Z. Untuk mempermudah pencarian, gunakan: Crtl+F dan ketik nama ilmiah atau nama lokalnya di kolom pencarian.     A Alap-alap (burung) Accipiter virgatus Alap-alap (kelelawar) Machairamphus aleinus Alap-alap Madu Pernis ptilorhynchus Alap-alap Sapi Falco moluccensis Alap-alap Sikra Accipiter badius Alap-alap putih Elanus caerulleus Alap-alap tikus  Elanus hypoleucus Angsa hitam Cygnus atratus Angsa putih  Cygnus olor Angsa Cygnus cygnus Anjing laut   Monachus monachus Anjing rakun Nyctctereutes procycnoides Anjing Canis lupus Anoa Anoa depressicornis Anoa pegunungan Anoa quarlesi Aus (Laba-Laba Berbahaya) Atraax robustrus Ayam buras Gallus domesticus Ayam G
Baca selengkapnya

Hormon dan Homeostatis

Gambar
Konsep homeostasis dikembangkan oleh Claude Bernard yang menyatakan bahwa organime hidup dipengaruhi oleh lingkungan eksternal dan internal. Komponen internal penting dipenuhi oleh cairan tubuh yang diproduksi dan dikontrol oleh organisme sehingga organisme tersebut menjadi lebih independen dari segala perubahan lingkungan luar dengan cara memelihara lingkungan interior secara konstan. Kebutuhan pemeliharaan keseimbangan ‘ internal milieu ’ diperoleh dari suplai makanan yang terus menerus. Tubuh memelihara diri secara presisi terhadap perubahan komponen-komponen cairan tubuh seperti ion-ion Ca 2+ , Na + , K + , oleh karena itu sel-sel sensoris dan endokrin berfungsi sebagai pengatur untuk memonitor konsentrasi senyawa-senyawa atau ion-ion. Jika konsentrasi metabolit tubuh berkurang / mengalami penurunan (seperti kehilangan cairan tubuh yang disebabkan oleh pengeluaran urin atau proses penguapan).  Proses monitoring berlangsung saat sel-sel sensoris/endokrin meng
Baca selengkapnya